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海洋委員會海洋保育署

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    委辦計畫成果

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    印太玳瑁基因體多樣性合作計畫-玳瑁樣本DNA萃取
    發布日期:115-01-28
    發布單位:海洋生物保育組

    完成69組實驗樣本的DNA萃取,來自27個不同玳瑁個體,目前完成樣本清單於附件三。其中54組實驗樣本的DNA品質符合標準,且電泳跑膠結果顯示DNA完整性高,無斷裂,成功率約78.3%。以樣本類型而言,血液樣本的DNA萃取步驟已建構,且全數萃取完成。僅少數個體(n=3,海保署編號為T-KH20190608-01、T-TT20210714-01、T-KH20231102-01)的血液樣本經過多次重複操作,DNA品質皆未達標準,但同批進行DNA萃取實驗的樣本,皆品質良好,故排除為人為操作所致。
           
           針對未來樣本採集、保存及DNA萃取的相關建議,目前海保署託管樣本及相關配套以符合粒線體 DNA和族群遺傳來源的相關研究。但若需進行全基因組定序(WGS)分析,其所需DNA量較高且需要更完整的DNA片段,才能提供最好的定序結果。建議未來有關單位額外採樣組織100mg至少一份及全血3mL至少一管,才能確認DNA萃取量足夠,且能搭配適合給WGS的DNA萃取試劑,如Gentra Puregene。註:目前及歷年來收集的組織樣本體積約為25mg或是1 mL全血,故本案僅能使用一般DNA萃取試劑,並以增加實驗重複組增加單一個體DNA總量。

    相關附件
    • 印太玳瑁基因體多樣性合作計畫成果報告書(含附錄)
    • 瀏覽人次: 320人
    • 更新日期: 115-02-06
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    海洋保育署