為增加海洋保育各界人士交流，於107年11月22、23日假高雄展覽館舉辦「2018海洋保育研討會」。本會議報名人數踴躍，參加人員包括中央、地方政府、大專院校、環保及保育團體、公民科學家等逾500人次。會中本署與專家學者、官方、產業代表、民間團體及公民科學家等人，針對「海洋污染及研究」、「海洋廢棄物治理」、「海洋生態系保育及管理」及「海洋物種保育」四大重點議題進行討論。

於108年1月15日舉辦「海洋野生動物保育研究研討會」，計80人參與。本研討會針對黑嘴端鳳頭燕鷗、海龜救傷及保育、鯨豚擱淺救傷及中華白海豚等四個議題，邀請各領域專家學者進行演講，本研討會也開放給民眾報名參加。研討會影片經講者同意後，已放上本署youtube網站供民眾瀏覽，擴大民眾參與。後續將針對桃園藻礁等議題，邀請相關專業人士與團體，共同商討可能的對策，並促使學者專家、NGO等環保團體與中央、地方的政府機關對話，共同交換意見。積極推動海洋保育知識交流，並有助於政策研擬與推動。