本署不定期邀請專家學者分享有關海洋生物或海洋污染等專題，107年12月10日、11日及26日邀請中山大學洪慶章教授、方力行教授及顏聖紘教授分別以「打一場成功的海洋保育戰」、「揭開台灣海洋生態的面紗-大數據分析訴說的不同故事」及「當新單位承接就任務應如何面對『外來水產動物活體審查作業』」為題進行專題演講，並開放一般民眾參加。

108年1月7日邀請時任行政院環境保護署宋欣真簡任技正兼副執秘分享「海洋污染防治法概要及案例探討」，1月23~25日邀請輔仁大學法律學院黃裕凱教授針對海洋污染防治法、海商法、國際海事法、國際海洋暨海事組織法等，進行三場演講。