全世界現存海龜有七種，海龜數量曾經非常多，但由於牠們生長速度很慢，在近一、兩百年各項人為因素與自然因素造成的生存壓力下，海龜數量不斷減少。海龜族群面臨的常見威脅包括人為獵捕、漁業混獲、船隻撞擊、海洋垃圾、產卵棲地開發、環境汙染和傳染病威脅等。目前所有海龜物種皆受瀕臨絕種野生動植物國際貿易公約，又稱華盛頓公約(Convention on International Trade in Endangered Species of Wild Fauna and Flora, CITES)保護，並列為附錄一(Appendix I)稀有或瀕危物種，其商業性國際貿易被嚴格禁止。

    臺灣海域可見到五種海龜，包括綠蠵龜(Chelonia mydas)、赤蠵龜(Caretta caretta)、玳瑁(Eretmochelys imbricate)、欖蠵龜(Lepidochelys olivacea)及革龜(Dermochelys coriacea)，均屬於第一級瀕臨絕種保育類海洋野生動物，受到我國野生動物保育法相關法令保護。

      海龜依照棲息地利用類型大致分為(一)產卵族群：在臺灣繁殖產卵，產卵季結束後就會回到原覓食棲地的海龜族群；(二)覓食族群：以臺灣周邊海域作為覓食棲息地或遷移中暫居臺灣的海龜族群。

 (一)產卵族群
       臺灣過去曾有綠蠵龜和赤蠵龜上岸產卵的紀錄，然而因棲地破壞及過度捕殺，產卵母龜的數量驟減，目前臺灣主要的產卵棲地包括澎湖縣望安島、臺東縣蘭嶼、屏東縣小琉球、東沙島及南沙太平島。

      澎湖縣在馬公本島及各離島的沙灘都曾有綠蠵龜上岸產卵，產卵季主要是6月中旬至10月初，以望安島為最主要的產卵沙灘。行政院農業委員會於1992年起開始委由相關學術單位進行澎湖縣望安島海龜的研究與保育，並1995年時，依據「野生動物保育法」列為「澎湖縣望安島綠蠵龜產卵棲地保護區」，總面積為23.3公頃，除積極加強巡邏取締與維護管理外，繁殖季期間亦僱用巡護人員定期巡邏調查，澎湖縣政府及縣警察局也會不定期巡邏，使得保護區避免人為的干擾，以達保育效果。望安島上共有7個產卵沙灘。此外，澎湖縣吉貝沙尾、北寮、林投和嵵裡沙灘，近幾年也有海龜產卵紀錄，而小白沙嶼、龍門、山水、青灣、後袋子和東嶼坪沙灘曾經被目擊到海龜上岸或爬痕，但沒有產卵紀錄。

      臺東縣蘭嶼的海龜生殖生態學約自1997年起展開，蘭嶼共有6個沙灘，其中八代灣、小八代灣和東清灣此3個沙灘有產卵紀錄，且幾乎整年都有產卵紀錄，產卵高峰期在6月到9月之間。與望安相比，蘭嶼新記錄到的產卵母龜數比例較高。依據1997年至2020年調查資料顯示，每年約有6成紀錄到的產卵母龜為新產卵母龜，目前是臺灣產卵母龜數量最多的島嶼；近5年來每年至少有10頭母龜產卵，2020年更有高達25頭母龜上岸產卵，共產下47窩卵。大多數海龜集中在小八代灣產卵，東清灣偶爾也有產卵紀錄。

       屏東縣琉球鄉產卵沙灘莫約於2011年展開生殖生態學研究，並曾評估設立小琉球綠蠵龜野生動物保護區。根據紀錄2011年到2022年間，每年約有2~7頭母龜上岸產卵，並產下5~15不等的窩卵，潛在產卵沙灘則有7處，分別為中澳、漁埕尾、龍蝦洞、蛤板灣、肚仔坪、美人洞及網美老木等。

      東沙島有綠蠵龜及玳瑁上岸產卵的紀錄。根據新聞報導，在1994、1995、2003、2011、2015、2017及2019年東沙皆有海龜上岸產卵的紀錄，其中108年記錄到母龜第一窩卵數為104顆，成功孵化61隻小海龜，孵化率達6成。太平島每年估計平均有30頭母龜上岸產卵，惟尚無確切資料。

(二)覓食族群
       臺灣已知的海龜覓食棲地有小琉球、澎湖、東沙和南沙太平島，臺灣全島近海如綠島、墾丁、蘭嶼、澎湖和東北角等地，也都有海龜目擊紀錄，僅有小琉球覓食族群的數量有系統性調查，2017年起估計每年平均有400隻左右，而2019年時透過空拍方式估算則約433隻，漲潮期間海龜數量最多的地區為肚仔坪，水下記錄海龜最多的區域為美人洞至花瓶岩一帶。2021年為評估原油突發性污染事件是否影響海龜族群生態，利用空拍機自7月至12月，總計調查26趟次，每次觀察到的海龜數量60至805隻不等，顯示此次油污事件短期內對小琉球棲息海龜族群影響應不大，且搭配潮位分析，記錄到花瓶岩礁台、美人洞沙灘外礁台、多仔坪潮間帶、杉福潮間帶、蛤板灣潮間帶、龍蝦洞潮間帶和漁埕尾潮間帶等幾處，水位高於20至30公分以上處，則會聚集許多海龜於此覓食，是小琉球海龜數量最多的覓食熱區。