臺灣海域鯨豚多樣性與豐度均相當高，孕養了32 種以上的鯨在此出沒且均列為保育類生物受到法律保護。然而除了白海豚之外，其他鯨豚的生態基線資料與保育近況資訊仍待更新。因此108年本計畫彙整歷年臺灣周邊海域鯨豚調查與擱淺的相關資訊，並測試「之字形穿越線」調查的可行性。
本年度(109 年)彙整鯨豚地理分布位置及擱淺的分布位置，以網格量化的方式探討區域性的差異。自1994 年起共計1744 筆擱淺事件，共有31 種鯨豚紀錄，常見擱淺種類如瓶鼻海豚屬(真瓶鼻海豚與印太洋瓶鼻海豚)於東北季風時期的擱淺頻度較高，需進一步確認種類與分析擱淺原因。
在花東海域的常見鯨豚種類族群量估算的部分，本年度於7-9月間共進行穿越線調查十八趟次(花蓮至台東成功港)，共目擊至少10 種的89 群次鯨豚群體，航線上目擊率為每百公里5.4 群次，主要以花紋海豚、抹香鯨及弗氏海豚為常見種類。目擊的群體大小與航線之距離將提供為後續族群密度之估算; 調查中並拍攝200 張高品質照片提供為保育教育用途。
