海洋保育署109年起委託專業團隊參考聯合國海洋環境保護科學領域聯合專家組(Group of Experts on the Scientiific Aspects fo Marine Environmental Protection, GESAMP)於2019年出版「海洋廢棄物監測和評估指南(Guidelines for the monitoring and assessment of plastic litter in the ocean)」觀測海底廢棄物。
海洋保育署111年委託專業團隊執行海底廢棄物調查，海底垃圾調查地點為基隆外木山、新北貢寮、桃園觀新、彰化彰濱、臺南臺江、屏東海生館、宜蘭龜山島、花蓮石梯坪及臺東綠島等九處海域，海域環境（離岸5海浬內）屬沙岸地形以拖網調查(彰化彰濱及臺南臺江)；屬岩岸地形以水下無人載具調查(桃園觀新、宜蘭龜山島及花蓮石梯坪)；屬珊瑚礁地形以潛水人員調查(基隆外木山、新北貢寮、屏東海生館及臺東綠島)。
111年總調查距離為131.4公里，並換算計畫每平方公里垃圾密度，調查結果以基隆外木山海域最高（17,619.05件/平方公里），其次依序為新北貢寮（5,833.33件/平方公里）、屏東海生館（4,791.67件/平方公里）、桃園觀新（500件/平方公里）、臺東綠島（208.33件/平方公里）、臺南臺江（104.17件/平方公里）、彰化彰濱（83.33件/平方公里）、宜蘭龜山島（0件/平方公里）及花蓮石梯坪（0件/平方公里）。
111年度海洋保育署委託專業團隊彙整分析海漂垃圾調查成果，由專業團隊、海洋保育署巡查員、海巡署及公民科學家以目視法進行調查，將臺灣海域分為八大海域範圍，分別是北部海域、臺灣海峽北部海域、臺灣海峽南部海域、東北部海域、東部海域、東南部海域、巴士海峽海域及東沙島海域，調查結果以北部海域密度最高（136.63件/平方公里），海漂垃圾組成以塑膠類占比最高（62%），其次依序為保麗龍（20%）、其他類（11%）及漁業用具（7%）。
微型塑膠調查海洋保育署111年委託專業團隊針對海水及生物體進行微型塑膠調查，海水及生物體樣品採樣點為淡水河、頭前溪、後龍溪、烏溪、濁水溪、八掌溪與急水溪、曾文溪、鹽水溪、二仁溪、阿公店溪、高屏溪與東港溪、四重溪、卑南溪、秀姑巒溪、和平溪及蘭陽溪。
海水水樣微型塑膠濃度介於0.02~1.63（個/立方公尺），濃度最高為後龍溪口水樣，最低為四重溪口水樣；生物體樣品塑膠微粒濃度介於0.01~2.58（個/克（濕重）），濃度最高為淡水河口生物體樣品，最低為四重溪口生物體樣品。
